上堆
将混合均匀的原料在发酵场上堆成底边宽1.8-3米，上边宽0.8-1米，高0.6-1米的近梯形条剁，条剁之间间隔0.5米。条剁的具体宽度和高度由翻抛设备而定。
在堆体的上、中、下部位，分别插入自动温度记录仪，每个堆体插入3-6个。
用2cm左右的细杆在堆体上自上而下斜插入多个透气小孔，一直插到堆体底部；每米堆体插入的孔10-20个。
当初始码堆气温低于15度时，可在堆体上覆盖一层塑料薄膜，当膜薄上有均匀水珠出现时，揭开塑料布。
翻堆
每一天的上堆发酵原料作为一个批次，并插上堆肥发酵标识牌。原料上堆后在24-48h内温度会上升到60度左右，保持24h后，开始翻堆（但当温度超过70度后，必须立即翻堆），翻堆时务必均匀彻底，将低层物料尽量翻入堆中上部，以便充分腐熟。
发酵结束
发酵堆肥过程由低温、中温、高温和降温四个阶段组成。温度由低向高再逐渐回落至与室温差距小于10度，即可结束主发酵。
将高温腐熟完的物料，后置腐熟10-15d，发酵完成后，水分降到35%以下。
记录
在整个发酵过程中，除进行翻堆操作外，应每日测量、记录发酵温度、物料含水量，做好生产记录。
